大豆响应NaHCO_3胁迫的转录组分析及耐NaHCO_3相关性状的QTL定位

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大豆响应NaHCO_3胁迫的转录组分析及耐NaHCO_3相关性状的QTL定位
论文目录
 
摘要第1-12页
ABSTRACT第12-16页
缩略词第16-17页
第一章 文献综述第17-41页
  1.1 盐碱地分类第17-18页
  1.2 盐碱胁迫对植物的危害第18-20页
    1.2.1 渗透胁迫阶段第19页
    1.2.2 离子胁迫阶段第19-20页
  1.3 植物耐盐碱机理的研究进展第20-23页
    1.3.1 渗透调节第20-21页
    1.3.2 离子外排第21-22页
    1.3.3 组织耐性第22-23页
  1.4 大豆对盐碱胁迫响应及机制的研究进展第23-24页
  1.5 大豆耐碱性种质资源鉴定研究进展第24-25页
  1.6 转录组学研究进展第25-27页
    1.6.1 转录组学概况第25-26页
    1.6.2 转录组学在植物耐盐碱研究中的应用第26-27页
    1.6.3 大豆耐盐碱转录组学研究进展第27页
  1.7 植物数量性状位点(QTL)定位研究进展第27-39页
    1.7.1 遗传标记技术的发展第27-28页
    1.7.2 分子遗传图谱的构建第28-30页
    1.7.3 数量性状基因的连锁定位第30-32页
    1.7.4 大豆耐盐碱QTL定位研究进展第32-39页
  1.8 本研究的目的与意义第39-41页
第二章 大豆耐碱指标评价及材料筛选第41-51页
  2.1 材料与方法第41-44页
    2.1.1 试验材料第41页
    2.1.2 试验设计第41-42页
    2.1.3 性状测定第42-43页
    2.1.4 表型数据分析第43-44页
  2.2 结果与分析第44-47页
    2.2.1 大豆耐碱相关指标的评价与筛选第44-47页
    2.2.2 耐碱和敏碱大豆种质资源筛选第47页
  2.3 讨论第47-51页
第三章 NaHCO_3胁迫下野生大豆的转录组测序与分析第51-79页
  3.1 材料与方法第51-57页
    3.1.1 供试材料及NHCO_3胁迫第51-52页
    3.1.2 取样第52页
    3.1.3 离子含量测定第52页
    3.1.4 RNA提取、cDNA文库构建和转录组测序第52-53页
    3.1.5 RNA-Seq数据分析第53页
    3.1.6 鉴定差异表达基因(DEGs)第53页
    3.1.7 基因注释、功能分类和富集分析第53-54页
    3.1.8 聚类热图第54页
    3.1.9 实时定量PCR (qRT-PCR)第54-57页
  3.2 结果与分析第57-74页
    3.2.1 野生大豆N24852在NaHCO_3胁迫下的表型变化第57页
    3.2.2 RNA-seq数据输出、质量控制、序列比对和基因注释第57-61页
    3.2.3 NaHCO_3胁迫下野生大豆根中差异表达基因的显著性分析第61-62页
    3.2.4 差异表达基因的GO、 KOG功能分类、KEGG通路分类第62-66页
    3.2.5 差异表达基因的GO富集分析第66-70页
    3.2.6 差异表达基因KEGG通路富集分析第70-73页
    3.2.7 转录因子富集分析第73-74页
    3.2.8 qRT-PCR验证第74页
    3.2.9 离子转运相关的差异表达基因第74页
  3.3 讨论第74-79页
第四章 大豆耐NaHCO_3胁迫相关性状的QTL定位第79-99页
  4.1 材料与方法第79-81页
    4.1.1 试验材料第79-80页
    4.1.2 试验设计第80页
    4.1.3 性状测定第80页
    4.1.4 遗传图谱构建第80页
    4.1.5 表型数据分析第80-81页
    4.1.6 QTL分析第81页
  4.2 结果与分析第81-97页
    4.2.1 NaHCO_3胁迫下两个RIL群体的表型变异第81-87页
    4.2.2 RIL群体NJRIZM6耐NHCO_3胁迫相关性状的QTL定位第87-91页
    4.2.3 RIL群体NJRILM6耐NHCO_3胁迫相关性状的QTL定位第91-94页
    4.2.4 两个RIL群体NJRIZM6和NJRILM6 QTL定位结果的比较第94-96页
    4.2.5 定位区间候选基因预测第96-97页
  4.3 讨论第97-99页
全文结论第99-101页
本研究主要创新点第101-103页
参考文献第103-115页
附录第115-139页
攻读博士学位期间发表的学术论文第139-141页
致谢第141页

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