菊属、亚菊属叶绿体DNA的基因组结构与进化分析

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菊属、亚菊属叶绿体DNA的基因组结构与进化分析
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
引言第9-11页
第一章 文献综述第11-21页
1 叶绿体基因组研究进展第11-19页
  1.1 叶绿体基因组的研究概括第11-12页
  1.2 叶绿体基因组的结构与功能特征第12-13页
  1.3 叶绿体基因组在系统发育分析中的应用第13-14页
  1.4 叶绿体基因与核基因互作第14-17页
  1.5 叶绿体全基因组测序技术研究发展第17-19页
    1.5.1 传统的DNA测序技术—Sanger测序法第17-18页
    1.5.2 基于二代测序(Illumina平台)的叶绿体基因组测序第18页
    1.5.3 第三代单分子实时测序技术第18-19页
2 菊科系统分类及菊属与亚菊属的研究现状第19-20页
3 本研究的目的及意义第20-21页
第二章 菊属、亚菊属叶绿体DNA提取第21-29页
1 材料与方法第22-24页
  1.1 植物材料第22页
  1.2 试剂与仪器第22-23页
    1.2.1 叶绿体提取所用的溶液配方第22页
    1.2.2 试剂盒提取叶绿体DNA所用的试剂第22-23页
    1.2.3 仪器与设备第23页
  1.3 提取方法第23-24页
    1.3.1 试剂盒法第23页
    1.3.2 改良试剂盒法第23页
    1.3.3 常规叶绿体DNA提取法第23-24页
  1.4 叶绿体DNA质量检测第24页
2 结果与分析第24-26页
  2.1 叶绿体DNA质量检测结果第24-26页
3 讨论第26-29页
第三章 菊属、亚菊属叶绿体基因组结构分析第29-51页
1 材料与方法第30-31页
  1.1 植物材料第30页
  1.2 叶绿体DNA测序第30页
  1.3 叶绿体基因组基因注释方法第30-31页
  1.4 叶绿体基因组基因比较方法第31页
2 结果与分析第31-49页
  2.1 菊属、亚菊属叶绿体基因组基本特征第31-38页
    2.1.1 叶绿体基因组结构组成第31-33页
    2.1.2 AT含量比较第33-35页
    2.1.3 叶绿体基因组序列组成第35-36页
    2.1.4 叶绿体基因组中基因信息第36-38页
  2.2 菊属、亚菊属IR区边界比较分析第38-43页
  2.3 菊属、亚菊属重复序列和SSR分析第43-48页
  2.4 菊属、亚菊属叶绿体基因组全序列比对第48-49页
3 讨论第49-51页
第四章 菊属、亚菊属叶绿体基因组的系统进化分析第51-57页
1 材料与方法第52页
  1.1 材料第52页
  1.2 叶绿体基因组系统进化树的构建方法第52页
2 结果与分析第52-54页
3 讨论第54-57页
全文结论第57-59页
创新之处第59-61页
参考文献第61-67页
附录第67-81页
致谢第81-82页

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